Inhoud

Biotechnologie gaat over de manipulatie van de moleculaire biologie van een cel. In de moleculaire biologie bestudeert men de basismachinerie van een cel, gaande van DNA, RNA tot eiwit. 
Biotechnologie II: proteïnen is opgebouwd met afwisselende delen theorie en techniek. In Biotechnologie II: proteïnen bestuderen we het eiwitsyntheseproces, de opbouw en basismanipulatie van eiwitten en hoe eiwitten geanalyseerd en opgezuiverd kunnen worden. Verder bestuderen we de regulatie van gentranscriptie door eiwitten en hoe de interactie DNA (of RNA) met eiwitten kan geanalyseerd worden. Biotechnologie II: proteïnen bouwt verder op Biotechnologie I: DNA en RNA, Biomoleculen en Fysiologie, en bereidt de student voor op Biotechnologie III: advanced (3FBT).
De belangrijkste technieken aangeleerd in Biotechnologie II: proteïnen zullen ook in de praktijk ingeoefend worden in het Labo Biotechnologie (2FBT & 3FBT).

De opbouw van de hoofdstukken gebeurt als volgt:

- eigenschappen van eiwitten en de genetische code

- eiwitsynthese (met inbegrip van gesecreteerde eiwitten) bij prokaryoten en eukaryoten

- eiwittechnologie:

• isolatie van eiwitten,
• concentratiebepaling van eiwitten,
• SDS-PAGE, IEF/IPG, 2D gel-elektroforese
• Western blotting
• verschillende vormen van eiwitchromatografie (ionenuitwisselingschromatografie, HIC, metaalchelaatschromatografie, affiniteitschromatografie) en gelpermeatie
• Concentreren van eiwitten

- genregulatie bij prokaryoten (waaronder lac, trp, en ara operon)

- genregulatie bij eukaryoten (transcriptiefactoren, enhancers/silencers/LCR, epigenetische factoren, miRNA) 

- opsporen van regulatorische elementen (DNAse footprinting, gel retardation, yeast one hybrid en chromatine immunoprecipitatietechnieken)

Studiemateriaal

 https://studiemateriaal.odisee.be/publiek/OlaFiche.aspx?OID=17718 

Biotechnologie II: proteïnen wordt gestudeerd via een cursus geschreven door de docent. Er wordt op Toledo ook extra leermateriaal geplaatst. Daarbij wordt duidelijk vermeld of dit te kennen leermateriaal is, of illustratief leermateriaal.

Toelichting onderwijstaal

Naast Nederlands is ook Engels belangrijk voor verschillende aspecten van biotechnologie. Er zal gebruik gemaakt worden van Engelstalige begrippen en van Engelstalige wetenschappelijke literatuur.

Toelichting werkvorm

Begeleide zelfstudie - Digitaal leren - Oefeningen/opdrachten

De theorie wordt aangereikt als ingesproken powerpoints of live lessen en aan de hand van een overzichtelijke cursus. De powerpoints worden tevens "niet ingesproken" ter beschikking gesteld op Toledo. Het merendeel van de colleges wordt live on campus georganiseerd. 

Tijdens de colleges worden de diverse moleculair biologische aspecten en de daarvan afgeleide technologieën toegelicht. In de cursus en de colleges worden oefeningen/casussen opgenomen zodat je jezelf kunt testen en aldus inzicht kunt krijgen over de mate waarin je de leerstof begrijpt en kunt toepassen. Sommige van deze oefeningen kunnnen ook worden aangeboden als extra materiaal via Toledo en behoren tot facultatieve zelfstudie.

Verder wordt er tijdens de colleges ook tijd voorzien waarin studenten begeleid oefeningen maken. Tijdens deze oefenmomenten worden vraagstukken/oefeningen gemaakt op de theorie, dit hoofdzakelijk on campus. Er wordt verwacht dat de leerstof van de ingesproken powerpoints en live lessen systematisch wordt verwerkt door de student, zodat de student de vraagstukken/oefeningen kan oplossen tijdens deze oefenenmomenten. Hiernaast wordt er ook een actieve bijdrage verwacht van de student tijdens deze momenten. 

Ondersteuning

• Naar het einde van de semester toe wordt er een monitoraat georganiseerd waarin vraag-gestuurd extra uitleg wordt gegeven voor de studenten die hier nood aan hebben.
• De studenten kunnen via een door de docent bewaakt online forum aan elkaar en aan de docent verdiepende en verklarende vragen stellen.